安装github上R包出错的处理方法,gwasglue安装不了
时间:2023-08-22 来源:生信自学网 作者:伏泽
微信公众号:biowolf_cn 点击:次
最近很多学员在安装gwasglue R包时遇到问题,界面会显示说“HTTP error 403”
install.packages("devtools")
devtools::install_github("mrcieu/gwasglue", force = TRUE)
在安装github上的R包时,经常会遇到这个问题,这是网站github上下载包,出现API下载速率限制的问题,并要求使用github_token取消api rate的限制。 解决方法就是申请一个github的token,然后保存到自己的R。 方法如下: 注册一个github账号,网址:https://github.com/
点击右上角头像,选择菜单“Settings”
左侧菜单选择“Developer settings”
左侧菜单选择“Personal access tokens”--"Tokens(classic)"
选择点击“Generate new token”--"Generate new token(classic)" 进入填写界面,Note里面自己填个名称,英文的 Expiration选择有效期,一般选长期有效即No expiration
下面的选项全部勾选
然后点击后面的Generate token,网站会自动创建一个token
记得保存好自己的一串字符,以后要用,也只会展示一次。 打开R4.3.0或者更高版本
在R界面输入这一串命令:usethis::edit_r_environ() 按回车,会弹出一个窗口,输入这一句命令GITHUB_TOKEN="ghp_6pqPFJSm8888888888888888888",其中“”里面的就是自己刚申请的token字符
输入这句命令之后,ctrl+s保存,就可以关闭R 然后重新启动R,复制命令就可以获取GITHUB安装R包的权限了。 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |