Cytoscape如何计算节点和边数目node和edge计数
时间:2020-03-12 来源:生信自学网 作者:乐伟
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| Cytoscape软件做生信分析中的作用非常强大，用到相关性分析，Cytoscape可视化是首选 在学员学习过程中，经常会问到三个问题： 如何计算节点数目 如何计算边数据 如何查看与每个节点连线数目 首先按照课程讲解构建网络，然后进行重要的操作 Tools——Network Analyzer——Network Analysis——Analyze Network  是的就是这么简单，然后在操作界面的右下角就可以看到结果展示：  首先查看节点数目和每个节点相关的节点： 点击Node Table，然后再上面有个保存按钮，弹出保存框，保存数据到本地：  保存之后，我们就可以看除表头数据的行数，这个就是网络里节点的数目：  接下来找到这个表格的Degree列，这一列就是每个节点与其相关的节点数目，用Degree排个序，就可以找到核心节点了  这样就轻松搞定两个问题，还有一个就是边的数目： 我们回到Cytoscape，再右下角选择Edge Table，保存数据到本地：  打开保存的文件，看下除表头文件有多少行，就直到边的数目，是的，困扰大家很久的难题就是这么简单，零基础学生生信，就上生信自学网 精品课程推荐： 《中药复方网络药理学联合GEO》 《Cytoscape软件操作》 《GEO芯片单基因文章套路》 (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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