环状RNA测序数据分析
时间:2017-07-10 来源:原创 作者:Wolf老师
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| 环状RNA是mRNA在剪接的过程中，上游exon的5'端与下游exon的3'端剪接在一起，从而形成的首位相接的环状RNA分子。 circRNA的特点 大多数定位于细胞质，且序列高度保守。 比线性RNA更稳定，不易被讲解。 许多circRNA表达水平与线性RNA的表达水平相当，一些circRNA的表达水平甚至超过他们的线性异构体10倍。 大多数来自蛋白质编码基因的外显子。 大部分是非编码RNA（noncoding RNA，ncRNA）。 circRNA功能 与miRNA相互作用。 circRNA通过碱基互补配对直接调控其他RNA水平。 circRNA能与蛋白质结合，抑制蛋白活性、募集蛋白质复合体的组分或调控蛋白质的活性。 一些circRNA可作为翻译的模板指导蛋白质的合成。 环状RNA测序 RNA测序（RNA sequencing,RNA-seq）和生物信息学技术的快速发展，使大规模分析转录组数据成为可能。 三种建库类型 polyA尾抓取RNA rRNA delete RNase R处理 环状RNA数据库 circRNA合并并统一了成套circRNAs，并且能够在基因组环境中访问、下载和浏览支持他们表达的证据。   (责任编辑：伏泽 微信：18520221056) 
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