生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

  • NetworkAnalyzer计算网络相关属性

    日期:2020-08-22 13:27:26 点击:3580 好评:0

    在cytoscape3.0版本以后,集成了NetworkAnalyzer工具,这个工具可以方便的计算常用的拓扑属性。...

  • cytoscape—cytohubba查找hub节点

    日期:2020-08-22 12:47:22 点击:16768 好评:0

    Hub基因通常都是具有代表性的一些基因,如何从众多基因集中找出它的真身呢?今天我们给大家介绍以下Cytoscape中的Cytohubba模块。 ...

  • 免疫细胞相关性检验

    日期:2020-08-17 17:37:47 点击:7405 好评:0

    上一篇文章我们向大家介绍了免疫相关性分析的第一种方法,这一次我们要讲解免疫细胞相关性分析的第二种方法,也就是相关性检验的方法。...

  • 免疫细胞可视化与差异分析

    日期:2020-08-16 14:57:06 点击:6500 好评:0

    们已经得到了每个样品中免疫细胞的含量,接下来我们就可以对这个免疫细胞浸润的结果进行可视化,然后对免疫细胞进行差异分析。...

  • 多GSEA富集图及免疫细胞浸润

    日期:2020-08-16 13:44:46 点击:5687 好评:0

    通过GSEA富集分析,我们就可以知道我们基因它是通过什么样的功能,或者什么样的通路来影响肿瘤的发生。然后我们就可以对GSEA富集的结果的结果进行可视化,绘制多GSEA的富集图。...

  • GSEA输入文件的准备和富集分析

    日期:2020-08-16 00:55:01 点击:6421 好评:0

    我们这次要讲解的是GSEA富集分析。GSEA是一个计算的方法,用来确定是否一个预先定义的基因集,能在两个生物学状态中显示出显著的一致性的差异。...

  • 单基因生存分析和单基因临床相关性分析

    日期:2020-08-15 01:34:34 点击:10307 好评:0

    接下来我们要讲解单基因的生存分析,目的就是看一下我们的基因是否跟预后相关。做完生存分析后,我们就要做单基因的临床相关性分析....

  • 单基因的差异分析与单基因的配对差异分析

    日期:2020-08-14 23:10:26 点击:7385 好评:0

    我们已经找到了预后相关的核心基因,之后,我们可以用我们的得到的预后相关的核心基因进行后续的单基因的套路分析,我们首先可以做单基因的差异分析。...

  • Cox分析与预后相关的核心基因

    日期:2020-08-14 11:59:04 点击:5993 好评:0

    我们已经得到了Cox分析需要的输入文件,接下来我们就可以进行Cox分析,接下来我们就可以将蛋白互作网络的核心基因和预后相关的基因取交集,得到预后相关的核心基因。...

  • GSEA法基因功能富集分析原理详解

    日期:2020-08-12 14:37:56 点击:7752 好评:0

    GSEA是一种基于基因集的富集分析方法,在对基因表达数据分析时,首先确定分析的目的,即选择MSigDB中的一个或多个功能基因集进行分析...