TCPA数据库数据整理利用impute包补充缺失值
时间:2020-01-28 来源:生信自学网 作者:乐伟
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TCPA数据库数据整理 下载的数据中,有些癌症有缺失值,这个时候就需要对数据进行整理,用R包对缺失值进行填充。 这里用到的R包是Bioconductor – impute包 安装方法: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("impute") 安装好之后调用R包:library(impute) 用到的函数时imupute.knn() 处理完之后把数据保存好用于后续分析,这样就把缺失值都补充好了,数据整理完毕,进行接下来的分析 精品课程推荐: 《中药复方网络药理学联合GEO》 《TCGA单基因挖掘套路》 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |
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