风险曲线绘制TCPA数据库模型蛋白
时间:2020-01-30 来源:生信自学网 作者:乐伟
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风险曲线绘制TCPA数据库模型蛋白 风险曲线包含三个部分,横坐标是一致的,从左到右病人的风险是依次增大的 最上面的图,横坐标是一个一个的病人,纵坐标代表病人的风险值,从左到右,风险值不断上升,根据中位值分成高低两组,红色为高风险组,绿色为低风险组 中间图形纵坐标是生存时间,这个图,分析希望得到的结果是,从左到右,随着风险值的增大,病人的生存时间是下降的,红色点代表死亡,绿色点代表存活 下面图是表达热图,横坐标从左到右风险一次增加,模型蛋白表达和风险的关系可以从热图中看出,可以看出,有些蛋白从左到右,热图颜色逐渐变红,也就是风险随着该蛋白表达增加而增加了 输入文件:risk.txt 用到的R包:install.packages("pheatmap") 调用R包:library(pheatmap) 精品课程推荐: 《中药复方网络药理学联合GEO》 《单细胞测序分析》 《TCGA单基因发文套路挖掘》 (责任编辑:伏泽 微信:18520221056) |
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