调查透明细胞肾癌TMB的预后及其与免疫浸润的相关性...
转录数组的下载,数据的管理...
转录数据id的转换 临床数据的下载和整理...
突变数据的下载 maftools可视化...
通过计算TMB和合并肿瘤数据对肿瘤进行生存分析...
主要分析肿瘤突变负荷在不同的临床分组间是否具有差异,按肿瘤突变负荷对我们的表达突变数据进行分组,从而得到转录组的矩阵。...
高低突变负荷组的差异分析,基因名称转换成id...
GO富集分析与KEGG的富集分析...
GSEA富集分析...
通过免疫细胞浸润的算法计算每个样品中免疫细胞的含量...