生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

  • TARGET儿童肿瘤数据库下载临床和mRNA-seq数据

    日期:2019-07-30 07:14:35 点击:18604 好评:-2

    TARGET数据库是儿童肿瘤数据库,适合做儿童肿瘤分析和挖掘,对TCGA数据库做了很好的补充,而且针对性更强。...

  • ArrayExpress数据库挖掘(类似GEO数据库的另一个芯片

    日期:2019-04-19 06:46:27 点击:4001 好评:8

    ArrayExpress与Geo数据库类似,里面都存储这大量芯片表达数据,对于数据库挖掘的学员来说,ArrayExpress是一个不可或缺的数据库。...

  • 中药网络药理学分析思路探讨

    日期:2019-01-17 14:50:45 点击:4552 好评:-6

    网络药理学是基于系统生物学理论,对生物系统的网络分析,选取特定信号节点进行多靶点药物分子设计的新学科。...

  • R语言学习资料大全(持续更新)

    日期:2017-11-07 11:54:22 点击:3065 好评:6

    学习R语言可以利用很多资源,学习这些资源可以更好的学习R语言,生信分析R语言...

  • 高通量测序数据发文思路

    日期:2017-08-15 07:27:17 点击:4745 好评:10

    随着高通量检测(基因芯片/二代测序)价格的降低,全基因组检测也成为较为常规的实验之一。然而面对动辄几万个基因的高通量数据,后期的数据分析显得尤为重要。...

  • TCGA差异基因做火山图

    日期:2017-08-12 07:13:14 点击:15979 好评:2

    TCGA数据库数据下载得到表达矩阵,用表达矩阵做差异分析,可以得到差异基因,以及差异基因相关的logFC和矫正后的P值,利用这两列数据可以画一个火山图,直观表示差异基因的上调下...

  • lncRNA深入分析方法

    日期:2017-08-12 04:29:22 点击:4098 好评:0

    长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。 研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生...

  • miRNA命名规则

    日期:2017-08-11 20:23:04 点击:6185 好评:0

    以动物microRNA为例 一、 确定命名规则之前发现的microRNA,则保留原来名字,如cel-let-7。 二、 在提交新的microRNA到数据库时,按照microRNA family顺序分别编号命名,如数据库中已有mir-41,那...

  • Affymetrix芯片数据上传到GEO数据库

    日期:2017-08-11 20:05:17 点击:2094 好评:4

    GEO数据库上传芯片数据...

  • circRNA环状RNA功能分析

    日期:2017-08-09 07:08:49 点击:6380 好评:4

    circRNAs 由于其特有的结构和复杂的功能机制,对其研究起步较晚,但已证实其具有重要的调控作用并在疾病发生中发挥重要作用,成为 RNA 和转录组研究的热点。...